陳總統在第一時間內獲知美國攻擊行動，指示行政院在凌晨召集緊急會議，陳總統也在上午八點、舉行高層應變會議。總統強調，我國支持美方立場，也作好一切應變措施，對於美國及相關盟國戰機，如果有需要通過我國領空時，也將全力配合。

　　凌晨的行政院燈火通明。一輛輛黑頭車開入，陳水扁由國安系統在第一時間告知美方採取攻擊行動後，立刻指示行政院召開緊急應變會議，部份首長紛紛趕到，交通部長葉菊蘭更由女兒陪同坐計程車趕來。

　　陳總統也在上午八點召集行政部門和國安情治系統舉行高層應變會議。總統表示，在獲知美國開戰後，我方五十五項因應計畫及二十一項突發狀況的國安機制立刻啟動。總統強調，政府以作好萬全準備，國人要有信心。總統也要國軍戒備，維持台海情勢穩定。(周明華 何家俊 王永秦)