這波腸病毒怎麼那麼毒？有學者認為，可能和去年口蹄疫豬隻掩埋不當，污染地下水有關。不過農委會不這麼認為。

　　去年口蹄疫肆虐台灣時，死豬大量堆積如山，雖然有些是焚燒處理，但大部份是找空地挖洞掩埋，學者認為，這種處理方式極可能污染到地下水，進而污染到河水，山泉水等地表水體。

　　學者指出，口蹄疫處理不當的病菌還可能造成傷寒熱，下痢，瘧疾等疾病的傳染，衛生單位在防治上也應該多加注意。

　　農委會則重申，腸病毒和口蹄疫並沒有直接關係。這兩者都非人畜共通疾病，要說腸病毒是病死豬處理不當污染地下水所導致，恐怕太過牽強。