國民黨在獲知輸掉桃園縣長寶座之後，負責為方力脩操盤的國民黨秘書長吳伯雄、立即召開記者會，他說，這個結果雖然令人失望，但是可以接受。吳伯雄並且在選舉結果揭曉之後，提出辭呈。

吳伯雄以辭職來表明對這場選舉負責的態度，這是他上任後第一場輔選，雖然贏了花蓮，卻輸了桃園，桃園是吳伯雄的故鄉，更是吳伯雄曾經擔任縣長的地方，吳伯雄的心情可想而知。雖然難過，吳伯雄還是感激方力脩臨危受命，為義參選的態度，並且表明，國民黨在年比選戰提名策略不會改變，還是以操守品德為考量，吳伯雄說，這次國民黨真正為乾淨選風做了一次示範，吳伯雄說，戰敗原因非三言兩語能夠形容。

輸了選舉，吳伯雄還是很有風度的祝賀呂秀蓮，並恭喜許信良，吳伯雄說，政黨合作還是會繼續進行，良性的政黨競爭才是國家之福。