足協改選因台日關係協會會長邱義仁的參選資格引發爭議，國際足總派人來台瞭解後，來函說明FIFA並沒有「理事參選人一定要是會員」的規定，等同宣告邱義仁可以參選足協理事長。 因應《國體法》修正，足球協會同時也進行改選，但台日關係協會會長邱義仁先前被認定沒有會員資格，引爆選舉爭議，FIFA來台調查後作出裁示；按照FIFA來函，足協引用章程第8條規定參選人必須是會員，然而FIFA並沒有這種要求，所以能否參選得依照第32條候選人須由至少1名會員代表提名為主，等同宣告邱義仁將可參選足協理事長。 足協兩派僵持不下，如今FIFA來函釋疑，足協將會依法行事，也讓選舉爭議終於在世足開打前逐漸明朗。