為了追查這起重大槍擊案，台南地檢署檢察官將遺體送往高雄殯儀館，進行「電腦斷層掃描」，槍手8秒內狂射11槍，經過法醫解剖後初步確定，林士傑身中11槍，身上總共有超過20個彈孔，其中5槍貫穿胸腔，造成林士傑血胸是致命原因。而林士傑的女兒，台南市議員林依婷，強忍悲傷在殯儀館等待結果，一旁的媽媽淚流滿面，讓人鼻酸。

台南市永華宮人員VS.記者說：「(他每天來拜拜都差不多這時間嗎)，大部分都這時間來不然就晚一點可能7點多。」林士傑上週六，穿著一身休閒，來到台南永華宮拜拜，整個過程和廟方人員互動良好，就像老朋友一樣有說有笑，但這一幕幕都成了回憶。

台南市永華宮主委楊宗保說：「將近要30年都會來這裡拜拜，他來我們廟都有一個原則，廟就是廟一切單純，廟步入軌道之後他就退(主委)。」曾擔任過永華宮主委的林士傑，退位後成了榮譽主席，他相當虔誠。

只不過，這回林士傑遭槍手近距離開槍，短短8秒奪命，頸部、胸腔、肩膀、手臂發現槍傷，由於子彈進入軌跡、留存位置，都沒有辦法憑肉眼判斷，因此經過檢察官同意後，來到高雄南部法醫中心，採電腦斷層掃描鑑定，初步判定林士傑身中11槍，其中五槍貫穿胸腔，造成林士傑雙肺血胸死亡。

台南市地檢署襄閱主任檢察官蔡宗聖說：「本署檢察官於今日(9號)會同法醫師，歷時經4小時就林姓死者進行解剖鑑定，並比對槍創彈道及電腦斷層掃描資料。」高雄殯儀館人員VS.檢察官說：「你要進去嗎要進去CT室嗎(對對對)。」

9日一早8點42分，檢察官抵殯儀館前前後後，大約停留一小時隨後快步離去，但卻有重大進展，發現部分子彈仍卡在體內，10點林士傑的遺體被送上車運返台南，準備進行解剖，林士傑的女兒林依婷懷有身孕，強忍悲傷情緒處理爸爸後事，來到殯儀館等待結果，還不斷安慰一旁崩潰痛哭的媽媽，這一幕令人看了鼻酸。

台南地檢署襄閱主任檢察官蔡宗盛說：「進行解剖鑑定及槍創彈道比對。」震驚社會的案件，為了確切了解槍擊情況及死亡原因，大動作跨區鑑定加上解剖，比對彈道以彈追人，盡早釐清真相。，