今年3月陸委會就宣布10個兩岸定期航班航點，其中就包含南京，不過最近有民眾發現，中國東方航空「MU2945」班機，從南京飛往高雄，疑似沒有按照航向規定，從台北穿越台灣西部陸地，讓外界質疑有國安問題，對此民航局回應，這是「既有」的兩岸航路，航機如果遇到惡劣天氣，提出偏航要求，民航局會依照國際規範給予幫助。

上海的中國東方航空，就找上海人代言，男神胡歌帶你飛翔，從台灣想到上海玩，或中國其他地方都可以但卻爆出國安疑慮，有民眾發現，中國東方航空MU2945班機，從南京飛往高雄，不過仔細看疑似沒按照航向規定，從台北直飛，穿越台灣西部，前空軍官校教官于晧瑋表示，通常會接到W4航路為何不走，前機師張志豪說：「它走的航路也的確是正常的航路，或者前面已經跟你講說，那段有極度嚴重的亂流，那時候民航局可能就會選擇稍微脫離航道一下，比方說往右或往左做一個避讓。」

前空軍官校教官于晧瑋說：「沒有國安疑慮，事實上繞道飛的任何飛機到台灣，都可能會經過台灣上空。」

對此民航局回應，這是「既有」的國際航路和兩岸航路，依照國際民航作業，航機遭遇惡劣天氣提出偏航要求，涉及飛安會依國際規範給予偏航協助，不過專家也說要當心，前空軍官校教官于晧瑋說：「中共不會從陸地上來到台灣，他可能是坐著民航機穿著西裝，萬一這個飛機上全部好比說兩三百人都是共軍，沒辦法管除非就是真的兩岸整個關係斷絕。」

國外從前也發生過，航機偏離航道因為正副駕駛都昏迷，如果發生這種情形雷達會偵測到，詢問班機沒有答覆馬上會動作，而陸委會今年3月就宣布，定期航班航點有10個，其中就包括南京復飛已經幾個月，但近期兩岸關係緊張，一點風吹草動格外引起關注。