國立清華大學，27日下午接獲通報，有不明人士宣稱，在校內男廁放置爆裂物，最後證實是烏龍一場，但沒想到，28日下午同樣時間，又接獲通報，宣稱要在女廁放爆裂物，清大校方不敢大意，馬上成立指揮中心，並暫停開放公共區域，轄區警方也到場，進行地毯式搜查。

學生一如往常進出學校，看起來好像毫無異狀，但進到校園裡頭後，這才發現，員警打開廁所門逐一巡視，不放過任何一個角落，就怕會有外發生，也針對教室等公共區域，進行地毯式搜查，因為清華大學傳出有爆裂物，國立清華大學學生說：「這件事情就是來的很莫名其妙，而且也不知道炸彈具體會在哪，訊息也沒有傳的很踏實。」

原來國立清華大學，27日下午2點接獲通報，有不明人士在校園男廁裡，放置爆裂物，宣稱在5個小時後會引爆，幸好最後虛驚一場，但28日下午2點又接獲通報，要將爆裂物改放置在女廁，校方認為是惡作劇但沒有輕忽，直到下午4點半都沒有發現異狀，還是讓學生抱怨連連，國立清華大學學生說：「都是學生互傳（消息），校方給的訊息速度比較慢，所以就比較不安心吧。」

甚至還有在校學生，表示校方要求學生待在教室內，把門鎖起來，還怕被校方刁難不敢受訪，只敢怒不敢言，國立清華大學副校長簡禎富說：「校方成立緊急應變中心，非常感謝教育部，跟新竹市政府等單位的協助。」校方暫時關閉公共場所，要和警方合作，共同揪出幕後惡作劇的真正元凶。