政府先前宣布，在2016年5月20日之後興建的違章工廠要斷水斷電拆除，但到目前只有拆除16家，引發爭議；經濟部7月底公布，違規工廠位置和面積，統計顯示這4年間，農地上新增的違章工廠至少有317間，占用農地超過120.2公頃，依法都需拆除。不過環保團體認為，目前經濟部只有公布，已經新建好的工廠也沒有公開拆除情形。 橡膠工廠大火延燒快得嚇人，2019年這場位在彰化違章工廠的公安意外，讓鄰近居民被迫離開熟悉的家園避難，地球公民專員吳沅諭說：「因為當時的空氣太刺鼻很難忍受，消防水是直接灌入農田裡面，裡面包含了戴奧辛硫化物。」蓋在農地上的違章工廠影響公安，更有農地汙染問題，經濟部7月底公布，這4年來農地上新增的違章工廠，至少有317間，桃園150間最多，其次彰化縣44間、新北市35間，有一些甚至是賽車工程，實際做什麼難以得知，不過環保團體認為，這樣的違章工廠至少有2萬多間。 地球公民專員吳沅諭說：「它其實只公布目前所已知的狀況，但其實還有很多的工廠，還沒有蓋完但經濟部認定的是，必須要蓋好了有加工事實，才認定為新增建的工廠。」環團經濟部中部辦公室科長李信融說：「因為我們經濟部，用工廠管理輔導法來處理，知道加工事實才可以認定，我們才可以依法停止供水供電。」蔡政府命令在2016年5月20日之後興建的違章工廠要斷水斷電拆除，但目前只有16家進行，環保團體希望公布的更透明，且盡快進行拆除。