日月光科技大廠爆發偷排廢水污染後勁溪，有民眾跟華視新聞投訴，國立成功大學的環境資源研究管理中心，負責回收全國各大院校實驗室廢水的資源處理廠，疑似將廢水直接倒入水溝，環保局十月時發文列管。不過成大出面喊冤，說這是離職員工栽贓報復，他們並沒有亂排廢水到水溝，環保局說將會深入調查。 　　民眾用手機拍下，負責回收全國各大院校實驗室廢水做處理的「成大環境資源管理廠區」，怎麼水管正在將廢水直接排進水溝內。不只動態影像，還有大量照片，拍到有員工正在將不明液體倒入水溝，甚至紅色汙水排到路面，看了讓人觸目驚心。還有不明的廢棄物直接放在廠區空地內，難道成大沒有妥善處理研究室廢水？ 　　成大出面喊冤，校方認為，這是之前研究中心聘僱的三名員工，因為態度散漫，被解僱後，挾怨報復。解釋他們經費充足，不需要為了省錢亂排廢水，不過看看之前環保局曾在十月發文，針對環境資源研究管理中心現場查核，中間產物未處理量，沒有實際完成改善，將持續列管。 　　環保局說接獲投訴後，已經在進行查證，如果真的偷排廢水將會對成大開罰，但若是離職員工惡意報復拍假照片散播，將會觸法，目前正在深入了解當中。