大法官釋憲總統享有國家機密特權，總統府因此要求法院歸還機密單據，還有立委出面認為吳淑珍等人是協助執行機密外交，應該一同受到機密特權保護，不過合議庭決定繼續審理。

　　週五國機要費案開庭，氣氛很不尋常，被告和律師陸續進入法庭，不過其他人都被關在門外，為了保護國家機密，從這次開始國務機要費審理不公開，不過已經取得的公文和單據也不能還，因為總統不是被告，加上資料都是在釋憲前合法取得，合議庭好不容易突破一個難關，決定繼續審理，但又有新的挑戰。

　　儘管立委頭頭是道，不過大法官釋憲明文指出，只有總統一人享有國機密特權，這個保障並不擴及家人，何況這次國務機要費審理，本來就已經先排除陳總統的部份，因此沒有違背第六二七號解釋，起訴程序合法，還是會繼續審理下去。