前彰化縣長翁金珠在前主席林義雄勸進下，最後一刻加入民進黨主席之爭，宣布退出新潮流系，讓新系措手不及，總召段宜康對此表示失望和遺憾，宣布辭去總召職務以示負責，新潮流同時也發出聲明，將不會支持特定後候選人，為這場黨主席選戰增添變數。 　　段宜康沉重辭去新潮流總召一職，以大動作表達對翁金珠決定參選黨主席卻沒有事前先告知的無奈，面對黨主席之爭呈現三雄角逐局面，新潮流開會決議，沒有特定支持候選人，新潮流決定不選邊站，反而大聲批評陳水扁總統應該為民進黨目前亂象負起責任。段宜康忽然辭去新潮流總召，空出的職缺也將由新系大老洪奇昌先代理。