民眾更關心的是，這場大火燃燒的亞硝酸鈉會不會帶來嚴重的污染問題？在空氣污染方面，目前環保署的最新偵測，都還是屬於普通級；水源方面，大量的消防用水將工廠化工原料衝入溝渠，已經造成嚴重的污染。 　　發生大火的新晃化工廠不斷冒著黑煙，參雜不明成分的氣體不只污染空氣，搶救大火的消防水不斷流入河溝，從高空往下看，整條河黃澄澄的還不斷冒著泡泡，這樣的汙水流入附近灌溉溝渠，大大小小的水溝全被污染，環保單位雖然緊急派清潔車處理，從河裡抽吸這些污染的水源，並且在下游處設置阻絕點，但是附近的魚蝦已經全部死光，清潔車上也全部都是死魚。 　　這一場生態浩劫連帶影響附近農民的灌溉，沒有人敢取水澆菜。不只蔬菜遭殃，稻田雖然可以收割，但是遠從一公里外飄來一團黑黑的泡棉球，居民擔心稻子是不是已經被污染。 　　為了阻擋毒水繼續危害，環保局持續監測，檢測PH值和溶氧量都在可以接受的範圍，但是水被污染是事實，還有空氣污染的問題，超過七個小時的毒煙飄向市區，再向外擴散，專家警告中部五縣市的居民，最近有可能會下酸雨，一定要做好防範。