大陸失蹤和罹難乘客的家屬，失事四天後，終於趕到澎湖，其中還一度傳出一名七個月大的女嬰遺體被誤認的情況，不過最後證實是家屬的誤會。有大陸家屬反應希望比照小三通，讓遺體能從澎湖直航送回大陸，海基會原則同意，承諾會全力配合。