嫌犯鄭華洲開的是一輛編號LM-0700的小貨車，車上載有三包二十公斤，總重量六十公斤的黑色炸藥。鄭華洲在上午接近十一點的時候開到總統官邸，靠近南昌路的側門口，表示要進入官邸，同時聲稱車上有炸藥。駐衛警在巡查之後發現果真如此，於是將鄭華洲逮捕。警方表示，這是頭一回在官邸附近發生這樣的情況。 　　嫌犯鄭華洲的車上仍留有他在九月十一號於迪化街購買的化學物：氧化銅、硝酸鉀的估價單，同時還寫了調配炸藥的化學物質比例。 　　苗栗方面，苗栗縣警局通霄分局也在下午前往鄭華洲的住處搜索，找到碳粉、過氯酸鉀等化學原料，大約一百八十六公斤。他的家人表示，並不知道他前往台北，不過根據警方的記錄，鄭華洲曾經有妨害自由、違反槍砲彈藥刀械管制條例的前科，目前警方已經深入調查。 　　警方在查獲這件炸彈案後，最想弄清楚的是炸藥的成分和威力，因此盡快地送刑事局鑑識科鑑識。經過電子顯微鏡和分析儀的分析，證實是一般的黑色火藥，至於威力能不能真的炸毀總統官邸？目前還難以估計。 　　警方晚上前往苗栗，逮捕涉嫌提供原料和製造場地的吳官寶、柯惠旻夫婦，警方懷疑他們兩人可能知情不報，正深入查證中。