蘋果經歷過「天線門」、「折彎門」事件後，這次又有「晶片門」! 外電報導，iPhone 6S登台開賣，蘋果採用三星和台積電各自代工的A9處理器隨機出貨，比台灣還要早開賣的香港傳出退機聲浪，不滿三星代工的A9處理器版本續航時間比起台積電代工的少了2小時。這引起果粉反彈，想退換貨。 香港地區Apple Store同意提供完成預購的iPhone 6S系列機種，14天內均可隨時退款；而透過蘋果線上商店購買且已完成取機的iPhone 6S系列機種，若已經拆封則需額外收取25%拆封費用。 不過台灣沒有Apple Store，iPhone 6S是透過各大通路與蘋果授權通路販售，而且晶片處理器的品牌問題，不在退換貨的條件內。另外，蘋果也有發表聲明，表示A9晶片都是蘋果用最高標準檢視過的，2款晶片在正常使用下，所得的差異只有2至3%。