民眾黨立院黨團主任陳智菡，16日在臉書發出長文抨擊，北檢偵辦柯文哲涉貪案期間，曾收到法務部調查局函文，指柯文哲政治獻金使用方式，沒有違法，但北檢卻仍欺騙威脅證人與被告柯文哲政治獻金案違法。

北檢昨（17）日晚間則重砲回應，陳智菡所指函文，並非是「法務部的回函，批評陳智菡誤導事實、混淆視聽，並澄清檢察官本於職權認定事實，適用法律，不受調查局意見拘束。