黃國昌在黨主席一戰勝選後，放眼未來，挑戰正要展開，前主席柯文哲為黨內不分區立委設置的兩年條款，是否繼續執行？以及2026九合一大選布局，都是棘手的難題。學者分析，廢除兩年條款恐怕有損民眾黨政治誠信，至於九合一大選，藍白合可能是唯一選擇。

接下民眾黨主席大位，挑戰才正要開始，黃國昌首先面臨的問題，就是8席不分區立委兩年條款，會不會照舊施行。政治評論家曲兆祥說：「黃主席接任了以後呢，那麼如果他們沒有辦法全部，都照這樣子的一個政治承諾去履行的話呢，那麼確實是會招致外界，對他們一個政治誠信的質疑。」

黨內人士透露，目前8位立委都已經逐漸熟悉國會運作，確實有不少支持者認為，再過1年就換人，恐怕不利民眾黨整體作戰表現，但如果完全不執行，勢必減損民眾黨誠信，除了兩年條款還有2026九合一大選布局，也是棘手問題。

政治評論家曲兆祥說：「從目前的政治結構上來看，藍白合大概是唯一的一個選擇，這兩個黨如果不能夠團結成一塊，那它幾乎是很難跟執政黨進行競爭的。」難題接踵而來，就看黃主席如何拆彈因應。