柯文哲辭去民眾黨主席後，由立院黨團總召黃國昌，接下代理黨主席職務，不過時代力量前立委王婉諭批評，黃國昌應該比照同樣涉貪案的高虹安，將柯文哲移送中評會，予以停權，甚至退黨處分，對此民眾黨不願多做回應，黃國昌也強調跟柯文哲有同樣理念。

黃國昌扛下，「民眾黨代理主席」首日，2日一大早七點半召開晨會，一級主管一字排開，後頭白板寫著柯文哲八字箴言，「心存善念盡力而為」，記者VS.民眾黨代理主席黃國昌說：「(柯文哲)有跟你交接什麼內容嗎。」談起柯文哲，黃國昌直視前方欲言又止，抿了抿嘴唇，一度語塞。

民眾黨代理主席黃國昌說：「台灣民眾黨，在柯文哲前主席他的帶領下，黨的精神，黨的價值，非常的清楚，我們會延續著相同的精神。」開口閉口不離「柯主席」，畢竟民眾黨被貼上，「一人政黨標籤」，就怕少了柯P，政治能量難以延續，只是對比同樣涉貪污案的，新竹市長高虹安，被起訴後民眾黨火速停權，而柯文哲同樣被起訴，卻不見任何黨紀處分。

前立委(時力)王婉諭說：「(黃國昌)他應該要履行他之前的承諾，如果柯文哲拿了不該拿的錢，他會第一個跳出來批判，而不是像現在一樣，從8月一路護航到現在，護航到成為代理黨主席。」點名代理主席黃國昌，不該雙重標準，民眾黨不願多做回應，只不過現在，柯文哲將代理主席位置交棒黃總召，而非其他黨務高層，或許也考量不讓挺柯力量消散。

政治評論員康仁俊說：「黃國昌在這段時間，都是以柯文哲的捍衛者自居，柯文哲在這個階段，既然希望小草不要離開，當然是希望透過黃國昌的號召力，能夠再凝聚目前民眾黨支持者的向心力。」接下來民眾黨黨主席選舉，不只得面臨黨內權力重整，民眾黨下一步如何發展備受考驗。