在捲入貪汙風暴後，今(7)日中午鄭文燦宣布，請辭海基會董事長職務，強調「將在司法程序中，全力捍衛自身的清白」，對此總統府表示，總統賴清德尊重鄭文燦的決定，希望司法秉持毋枉毋縱精神，儘速釐清事實真相，但海基會董事長職務，接下來將由誰接任？目前傳出將由前自立晚報社長、也是前監察委員的吳豐山呼聲最高，而其實早在賴清德就職前、安排人事時，就曾想過由他出馬海基會董事長職務。

海基會董事長鄭文燦，透過海基會發出聲明，為了避免影響團隊政務推動，辭去董事長職務，將在司法程序中捍衛自身清白，總統府也隨即表示，賴清德尊重鄭文燦的決定，盼司法單位秉持毋枉毋縱精神，盡速釐清事實，高雄市長陳其邁說：「尊重司法毋枉毋縱，也希望說檢調可以，盡速釐清事情的真相。」

綠營從上到下喊話毋枉毋縱，就怕風暴再擴大，民進黨廉政委員會，將在8日下午6點半，在中央黨部召開臨時會，邀集一共11位委員，身分是學者或律師，討論是否要立案處理，不過得過半數委員出席才會成會。

根據了解目前會有6人到場，而開會結果將有三種可能，如果黨員有貪污等違反廉政行為，一審判決有罪者予以停權處分，二審判決有罪者予以除名，貪污所得超過50萬元等重大情節，經調查屬實者直接除名，特殊狀況者不在此限。

國民黨主席朱立倫說：「我是桃園的老縣長，對於桃園人來講，這是非常遺憾的事情，這件事情已經7年了，這時候來偵辦，我相信這是很多國人的疑慮，不管是司法單位或是民進黨，或是賴清德政府，應該說明清楚。」而民眾黨團總召黃國昌，則評論鄭文燦請辭不易外，民進黨是想斷尾求生。

如今鄭文燦請辭海基會董座，接下來將由誰接任，平面媒體報導，前自立晚報社長前監察委員，吳豐山呼聲高，因為賴清德在就職前安排人事時，本來就屬意由他出馬，立委(民)許智傑說：「海基會董事長需要一位，政治色彩較不鮮明的人選來擔任，相信賴總統，會做出最好的決定。」鄭文燦身為民進黨「接班世代」代表，如今爆發「貪汙疑雲」，請辭海基會董座，真相靜待司法查明。