網軍議題讓柯文哲頻頻向中央開戰，台北市長柯文哲上週在臉書，號召網友一人一信寄到行政院嚴查網軍，星期一晚間又在臉書，三問行政院長蘇貞昌，是誰讓網軍呼風喚雨，製造敵人？行政院長蘇貞昌上午回應，違法行為不容許，都會嚴查嚴辦。

就在週一晚間台北市長柯文哲又PO文了，內容提到，「致行政院蘇貞昌院長：我要請問蘇院長，是誰讓網軍呼風喚雨，黨同伐異？是誰一邊說要處理政黨及其附隨組織不當財產，一邊拿著國家資源來剷除異己，蔡總統高喊轉型正義邁向和解是誰在同胞裡製造敵人？請嚴查網軍，蘇貞昌上午回應尊重言論自由。」但是行政院長蘇貞昌說：「違法的行為不允許都會嚴查嚴辦。」

台北市長柯文哲說：「查那個林秉樞帳戶裡面的金流就知道了，我們都知道怎麼查但是我非常清楚，他們不會查他們查不下去啦。」但批評別人前恐怕也要看看自己，在柯文哲的貼文底下，以前負責幫柯文哲拍照，已離職的台北市府前攝影，就留言給柯文哲，是否用相同標準追查當初霸凌我的網軍，道德標準不該有雙標，而柯文哲的IG上午再度貼出，和侯友宜、鄭文燦出席活動的照片，寫著聽說這邊有3位網軍受害者。

台北市長柯文哲說：「這個看看就好其實也不是網軍治國，其實明白講是小編制國。」日前鄭文燦也說，自己也是網軍的受害者，被黑了很多年，桃園市長鄭文燦說：「該受到法律的制裁就要受到法律的制裁。」侯友宜也喊話，政府要正視，新北市長侯友宜說：「解鈴還是要繫鈴人大家齊心的，去想看看這個問題從何而來。」