太魯閣408次事故發生後，外界對台鐵的批評檢討聲不斷，交通部長林佳龍也已經請辭，雖然有觀光業、中華郵政和電信工會等各界表示慰留，但昨(12)日林佳龍再次強調會負起責任，沒有慰留的問題，同時昨天晚間、也寄出一封內部信給台鐵員工，提到台鐵的改革不夠好、不夠快，應該由他來承擔這些責任。

林佳龍站長，化身站務員慶祝台鐵雙軌化通車，提到台鐵似乎是交通部長林佳龍，心中最柔軟的一塊，也是最大的擔憂，而最終因為太魯閣號的慘痛事故，下台負責，交通部長林佳龍說：「我們要虛心接受各界的檢討，但對台鐵人來講，這又何嘗不是最沉重的傷痛。」

堅決請辭後，林佳龍也寫了一封內部信，寄給每一位台鐵員工，提到接任交通部長時，台鐵才剛經歷普悠瑪事故的嚴重挫折，當時提醒自己，應該背負起改革台鐵責任的，是自己和政府及整個社會。

而不單是辛勤付出的台鐵同仁，但短短三年之間，台鐵發生了兩次嚴重的事故，讓社會的悲痛更深，對每一位台鐵人來說，何嘗不是難以承受的傷痛，但從事故率來看，改革不夠好不夠快，應該由我承擔，也提到台鐵員工是最寶貴的資產，值得被善待，辭去交通部長，除了負責，更希望喚起各界和政府，對台鐵加速改革，但在林佳龍請辭後，台鐵員工的憂慮仍然在，台鐵企業工會理事長陳世杰說：「法令一定要鬆綁，台鐵能夠多角化經營，讓員工能夠看得到未來，這樣子才是比較好的方式。」