針對教育部長拔掉管中閔一案，現在越演越烈，但是吳茂昆臨時請假不出席備詢，卻在教育部接受部分媒體訪問，此舉讓國民黨立委火大、直接衝去前往教育部找人，且佔領教育部長室，但還是不見吳茂昆蹤影！不過台灣大學和台師大以及台科大聯合發表聲明，希望教育部尊重台大遴選結果，政教分離，政治退出校園！ 跨過馬路，國民黨立委來找教育部長吳茂昆卻硬是被鎖在門外。而開門成功後，直搗部長辦公室，卻不見吳茂昆人，國民黨立委立刻打電話給吳茂昆。會直搗黃龍，是因為國民黨立委要求吳茂昆到立院報告，吳茂昆卻臨時請假，他則是跑到總統府參加總統創新獎，更讓國民黨立委火大的是四月十號教育部第一次跨部會諮詢會議，吳茂昆還不是部長，卻早就已經參加。 國民黨立委撲了空，吳茂昆跑去總統府出席總統創新獎，台大遴委會也讓教育部吃了閉門羹，除了有合理理由否則不重新遴選，電話訪問台大遴委會發言人袁孝維，但是吳茂昆說台大不重啟遴選，校長是誰就交給校務會議決定，管中閔也發文反擊教育部說，天無照甲子人無照天理，大學自治是學術自由的骨幹，當政治力透過不斷恣意干，一路動員族群仇恨，台灣自由與民主，又還有什麼值得對外彰顯？ 由台灣大學台師大台科大組成的台灣大學系統，也同步聲明1.尊重台大遴選結果，2.尊重台大遴委會職權，3.教育部干涉造成校園對立不安，請尊重大學自主，4.政治與教育應該分離，政治退出校園，管中閔義務律師團也將提出釋憲和行政訴訟。 根據這份民國100年時，法務部發給教育部的函文依照「特別法優於普通法原則」，公立大學校長遴選時，應回歸到遴選運作辦法，教育部要用行政程序法擋下並不適用，依大學法第九條，一月五日台大遴委會選出管中閔為校長，一月十日報到教育部，教育部有聘任的行政處分義務，未在兩個月內為行政處分，原來應該受處分的人可提出訴願，訴願被駁回可再提行政訴訟，台大校長大戰烽火不只連三月。