在聲明中，吳茂昆針對外界的質疑一一做出說明，強調自己2002年已經放棄美國國籍，不曾接受中國國科院的職務，也沒有在中國的"西部超導材料科技有限公司"任職。 吳茂昆也說，公務人員依法行政是最基本的道理，自己所有的出差請假都有依規定辦理，而溢領學術研究費用是程序上的疏失，相關費用已經繳回，自己願意貢獻所長，但不應該被刻意抹黑栽贓。