馬總統和台北市長柯文哲在元旦升旗的碰頭，成了最大焦點，馬總統走上前和柯文哲握手時，柯文哲因為右手正拿著小國旗，所以是握著拳頭回應馬總統伸手致意，話也沒說，表情也放空，場面有點僵。 升旗典禮結束，柯文哲緊接著參加元旦健走活動，他被媒體問到與總統馬英九握手，他笑說自己當時正在想一個問題，就是「死亡之握跟回春之手到底誰比較厲害」。 在元旦健走活動前，柯文哲依然還是致詞越短越好，說「我看就出發吧！」柯表示「話講太多沒用，做事就好」，不過他也說的很白，又要跨年、還要升旗，選後比選前還痛苦，他也要大家趕快走完回家睡覺。 媒體在健走前訪問柯文哲跨年接著升旗又繼續健走會不會很累，柯則說外科醫師的話是可以，只是有沒有必要，他以前是為了救病人不得不早起，「這個實在是…覺得這麼早跑來不知道幹甚麼。」對於跨年和元旦活動，柯文哲似乎感到很莫名其妙。