不過在投票的現場，出現抗議的場面，為了大埔案，抗議民眾在投票所外、舉牌子、呼口號，還有台大學生，想上前跟總統陳情，卻被警方逮捕，在偵訊後，依妨害公眾往來安全罪，移送法辦。 　　國民黨主席選舉日，場內投票、場外抗議，為的就是大埔案，聲援民眾在投票所外舉牌呼口號，但有一名台大學生，走向馬英九陳情時，遭警方逮捕，並在偵訊後，依妨害公眾往來安全罪，上銬移送。 　　趁著馬總統來投票，聲援大埔案的民眾，舉牌抗議警方見狀馬上架離，關你們警察什麼事，語氣中滿是憤怒，其中一名台大的郭同學，還遭到警方上銬，博任當時情況，質疑警方太誇張，因為刑法第185條妨害公眾往來安全罪，是指損壞或壅塞公眾往來設備，可處5年以下有期徒刑拘役或500元以下罰金。 　　夥伴們聚集在派出所前等待偵訊結果，過了4個小時終於等到郭同學，不發一語被帶上車，郭同學將移送到地檢署偵訊，雖然起不起訴還要由檢察官認定，但警方是不是執法過當已經引發爭議。