為廣大興漁船血案赴菲律賓的我方調查團無功而返，法務部雖表示還是與菲保持磋商，但馬英九總統在國安高層會議裁示，調查團如果要再次赴菲，必須等菲國準備好，未來雙方合作調查，須以「對等」為原則，而且要白紙黑字記下調查事項。 　　遠赴菲律賓的我方調查團，無功而返，回台後召開記者會，譴責菲國毫無誠意，令人不滿與憤怒，法務部司長陳文琪，調查團表示雖然進展有限，但現在依舊與菲國保持聯繫，法務部司長陳文琪，馬總統也在18號晚間，第五度召開國安會議，針對以後台菲兩國的協商，一定要以對等互惠為原則，而且必須要白紙黑字，寫下調查事項。 　　以免這次調查團被漠視的事件再度重演，也凸顯了雙方司法不對等，至於海軍也將常態化，派遣船艦南進北緯20度，偵巡支援，不但能強化主權宣示，也能有效對菲國海防部門產生壓力。