已經退隱政壇的前國安會秘書長邱義仁，先前因為涉嫌詐取外交機密款50萬美元遭到起訴，不過台北地院宣判，認定這筆款項確實有執行，判決邱義仁和前外交部次長高英茂無罪。而另一名涉及南港展覽館弊案，洩漏評選名單的前內政部長余政憲，二審則是改判二年半的徒刑，不得緩刑。 　　前國安會秘書長邱義仁，在扁家弊案爆發時，被指控和前外交部次長高英茂涉嫌詐領外交部經費50萬美元，檢方依違反貪污防治罪條例起訴。不過直到邱義仁服刑出獄後，台北地院法官審理卻有了大逆轉，認為邱義仁和高英茂協助台灣在加入WTO世貿組織時，名稱不被矮化，證實這筆款項的確有執行，因此判決兩人無罪。 　　不過已經退出政壇的邱義仁，沒有到庭宣判，只透過律師對外發言。而同樣也跟扁家弊案扯上關係的前內政部長余政憲，因為當初涉嫌洩漏評選名單給吳淑珍，原本一審獲得緩刑，但是高院法官審理後，認為余政憲在洩漏招標文件中關於限制廠商投資的部分，並沒有坦承犯行，因此加重其刑，改判他2年半徒刑不能緩刑。而余政憲也發出聲明，說從頭到尾都不知道吳淑珍，有向其他人收賄，且自己沒有圖利，因此將會再上訴捍衛清白。