第一年舉辦北北基聯測就被教育部喊卡，一手促成聯測的台北市長郝龍斌只能無奈接受，而尷尬的是，還是由當年擔任郝市府教育局長的教育部長吳清基來否決，不過吳清基說北北基聯測沒有錯，只是時空環境不同，十二年國教開辦，才讓北北基無法繼續下去。 　　台北市長郝龍斌無奈接受，自己一手促成的北北基聯測就這樣只辦了一次就喊卡，明年開始，全國統一聯測考試。而台北市教育局也緊急和各校長開會研議，趕在開學之前給學生家長一個交代。郝龍斌似乎已經調整好心態面對接下來的問題，事實上，教育部決定停辦北北基，還是由昔日老部屬教育部長吳清基親自告訴他的。 　　真的是造化弄人，當年郝龍斌為了減輕學子負擔，推動一綱一本北北基聯測，和當時還是北市教育局長的吳清基聯手催生北北基，不過卻在吳清基入閣之後，卻以教育部長的身分否決了過去自己和老長官的決策，也讓外界質疑吳清基根本是自打嘴巴。北北基聯測畫下休止符，後續的政治效應有待觀察，不過目前最重要的還是得先解決後續問題，保障14萬個8、9年級的考生權益。