十月十日是中華民國98年國慶，不過因為88水災慘重傷亡，馬政府取消所有慶祝活動，只有中樞紀念儀式，馬總統說，實在沒心情慶祝，讓今年雙十國慶，氣氛冷冷清清，光輝十月，夜晚的總統府沒有華麗燈光，府前牌樓沒有慶祝國慶的字樣，白天凱道上也沒有旗海飄揚，98歲的國慶和過去相比，顯得黯淡，幾乎讓人遺忘國家生日。 　　唯一一場慶祝就是中樞紀念儀式，文武百官齊聚，但水災帶來的傷慟實在讓人感傷，總統說莫拉克颱風帶來不與山河爭地的教訓，未來嚴格執行國土保育，危險地帶不得開發，而國慶文告除了要提醒大自然的反撲，對於政治兩岸也多所著墨，馬總統強調儘速與大陸簽訂ECFA提升台灣產業競爭力，對於在野疑慮，呼籲政黨領袖對話，強調不會賣台，呼籲朝野對話，不希望政治土石流繼續內耗，對於建國100年，總統也明令蕭萬長擔任籌備會主席，規劃一整年活動，讓全世界見證台灣，中華民國百年盛事。