總統府秘書長葉菊蘭傳出請辭消息，雖然陳水扁總統再三慰留，但葉菊蘭堅持請辭不受慰留。最後總統府秘書長一職由國安會秘書長陳唐山接任，至於國安會秘書長遺缺則由副秘書長陳忠信代理，並且自三月二十六日起生效。