繼台北市選委會主委吳秀光之後，行政院第二波開鍘名單就是台中市選委會主委蕭家旗，他得知後痛批中選會將造成選務混亂，至於離島的澎湖選委會，為了抗議中央態度反覆，三十多名選務人員，集體請辭。
　　
　　一階段兩階段爭議越演越烈，行政院第二波開鍘，撤換掉台中市選委會主委蕭家旗，下班後才得知消息的他，痛批中選會已經失去獨立性。

　　行政院祭出鐵腕，先對堅持兩階段投票的台北市選委會主委吳秀光，開了第一槍，希望在選前十天，解決所有選務紛爭，但是中央強硬的態度，引發離島澎湖選委會不滿，集體請辭。

　　據了解，中選會已經提報第三波撤換主委名單，層級也不排除到達各縣市選委會的兼職總幹事，只是爭議能不能落幕，還是讓中央跟地方裂痕越來越大，恐怕還要觀察。