另外，馬英九挑副手搭檔蕭萬長，過程保密到家，連黨主席吳伯雄及競選工作室總幹事詹春柏，都是上星期五才被告知，馬英九毫不尊重體制及倫理的做法，引發內部相當大的反彈，黨內大老也私下議論，馬英九怎麼這麼不會做人。榮譽主席連戰和黨秘書長吳敦義也是在上星期五晚上十點以後才被告知，而電視在晚間十點就打出快報，等於包括連戰在內的所有黨務主管，都是看電視才知道。