陳水扁總統搭乘的空軍一號專機，在台灣時間3號下午1點10分左右抵達帛琉，由於菲律賓政府拒絕專機通過領空，空軍一號的飛行路線繞道日本的琉球飛航情報區，才抵達目的地。而我國設立總統專機58年來首次出國的航程，空軍方面也順利完成了歷史性的任務。 　　從花蓮401聯隊起飛的空軍F-16戰鬥機，漆著太陽標誌的塗裝，在陽光下特別耀眼，這三架編隊飛行的戰鬥機在台灣東部領空護航，確保總統與空軍一號的安全，這是空軍一號使用波音737-800型客機之後，總統第一次搭乘空軍一號出國訪問。 　　進入國際領空之後，總統走到後艙，向機上隨行的官員與媒體一一握手，總統回座位的時候，飛機突然遇到一股小亂流。 　　這時候，空軍一號剛好通過日本琉球飛航情報區，也就是總統出發前感謝日本的原因。 　　空軍一號的機組員隨後提供機艙內服務，為了準備這趟飛行，華航提供技術指導準備了一個多月，讓空軍專機上的空服士官，比照一般民航機的方式供應餐點與各項服務，而不是原先空軍規劃的軍方便當。 　　另外，為了模整個飛行任務，空軍一號還在出發前夕繞了台灣飛行四圈，預做訓練。談到這次的歷史性飛行任務，空軍一號的機組員都感到非常榮幸。 　　而從蔣經國總統時代就擔任空軍專機空服任務的畢嘉台士官長，32年來服務過三任的總統專機，倒是以平常心準備這次任務。 　　空軍一號比預定的時間提早抵達帛琉，平安的降落在帛琉國際機場，帛琉總統雷蒙傑索親自接機，當地民眾以及華僑團體烈歡迎，帛琉總統還希望陳總統來這裡可以放輕鬆。 　　空軍一號順利降落在帛琉機場，具有歷史性的意義，備受矚目，不過總統的外交活動內容，也同樣在這次的南太平洋訪問中，持續成為焦點。