台查斷交後，直接衝擊到的是不穩定的兩岸關係，陸委會認為兩岸經貿雖然交流頻繁，不過這類事件已經嚴重傷害兩岸人民感情，學者認為中國選在經續會後發動台查斷交，更加証明中國對綠營領導人不期待的心態。

　　自從扁政府上任以來，中國不斷以金援戰術來挖牆腳，企圖孤立台灣國際地位：從兩千零一年開始，中國以金援及承諾在聯合國支持，迫使馬其頓和台灣斷交之後，2002年陳總統接任民進黨主席之際，中國諾魯，導致台諾斷交，接著賴比瑞亞及多米尼克紛紛以金援因素和台灣斷交，中國緊接著在去年連續策動兩國，格瑞那達和台灣斷交，到今年的台查斷交，中國挖牆腳伎倆越演越烈，幾乎每年上演。

陸委會認為中國這種做法不能改善兩岸關係。而學者更是直言，所謂的蘇修路線還對中國釋出善意，看來中國根本不理會。學者提出台查斷交後的兩岸關係見解，不過中國對台灣沒有坐下來談判的意思，台灣單方面檢討恐怕於事無補。