不只行政院預算被大砍，總統府預算也被刪了四千一百多萬，陳總統的國務機要費被砍了三成，立法院並附帶要求廢除人權諮詢委員會等沒有法源依據的單位，就連台北賓館往後也不能再用來召開政黨會議，呂副總統對泛藍的惡意主導，相當遺憾。 　　朝野恩怨大算帳，總統府也成了國親黨團下手目標，總統府預算一共被刪除四千一百多萬，而向來被視為總統私房錢的國務機要費，一口氣被刪了一千五百多萬，是去年的六倍，立法院還決議附帶，要求廢除總統府人權諮詢委員會，以及青年團等等沒有法源依據的單位，讓擔任人權諮詢委員會主委的呂副總統相當不滿。 　　副總統感到遺憾，但立法院的要求還沒完，國安會成員未來不能涉入國內選舉政治，就連台北賓館，以後也不能再讓陳總統用來召開政黨會議，這一次，在野黨的針鋒相對，總統府感受得格外深刻。