邱小妹妹的人球案也讓台北市長馬英九陷入空前的政治危機，台北市議員不分藍綠強烈炮轟馬英九超級狀況外。先是在案發第一時間沒有掌握邱小妹命在旦夕的嚴重性，接著懲處名單又一改再改，甚至仁愛醫院原本可以挪出病床，也是經過張珩局長質詢脫口而出馬英九才知道。 　　副總統呂秀蓮今天就痛批，馬英九愛作秀，應該多花精神在市政上。上任六年又二十二天，台北市馬英九從來沒有像這次這麼邱小妹事件第八天，台北市長馬英九府團隊每天都有新發現，馬英九執政六年又十五天遇上最大的政治風暴，空前政治風暴，後知後覺狀況外，藍綠議員都看不下去。