台北市長馬英九，在這場抗爭事件中，面臨兩難的局面，他必須維護首都的安全，但是帶頭抗爭的對象是連宋陣營，因為角色尷尬，他一度指派副市長歐晉德到場安撫群眾，卻被當場丟東西抗議。 　　目前最新進度是核准集會時間，到晚上十點為止。一整夜沒有闔眼休息，台北市長馬英九已經坐鎮治安指揮中心超過十幾個小時，由於他身兼台北市長和連宋競選總部總幹事兩個角色，但是他強調絕對以首都治安為至高無上考量。 　　他呼籲目前靜坐在總統府前的選民要冷靜理性，也強調所有過程都依集會遊行法辦理，絕不寬待，包括已經對連宋陣營製造噪音開出三萬塊錢的罰單，陳呂陣營開出三千塊罰單，至於連宋陣營提出選舉無效的訴訟，他表示支持目前他扮演的是地方政府和中央溝通的橋樑角色，一方面呼籲選民理性，也要求中央趕緊達成選民的基本訴求，才是平息這場集會遊行的解決之道。