花蓮強震除了民宅倒塌，多個校園也受損嚴重，連假後首個上課日，其中包括綜合大樓嚴重毀損的花蓮女中，因為其餘校舍影響較小，仍然正常上課，預估一週後將進行拆除作業，到時候會改採線上教學，另外包括慈濟大學，校舍內包括電腦及器材都毀損，今(8)日停課不停班，教職員整理校園希望盡快恢復原狀，另外，因為地震引發大火的東華大學，理工學院大樓校方已經決定異地重建。

花女綜合大樓，一路向前梁柱磁磚全掉光，鋼筋裸漏結構完全變形，教室岌岌可危走廊上滿是碎石塊，花蓮女中綜合大樓校舍，因為大地震嚴重毀損成了一棟危樓，學生家長說：「多少都有一些(害怕)，但也沒真的那麼恐慌，校方還滿貼心的，會透過一些社群，告訴我們家長建築物的狀況。」

花蓮女中學生說：「上課不會在那裡(危樓)上課。」因為不會去那棟上課，好在其他校舍影響較小，今(8)日上午學生仍然進到學校上課，但校方為了安全急著將這棟大樓拆除，馬不停蹄忙著災後重建，花蓮女中校長詹滿福說：「(危樓重建)初估是兩億兩千萬，拆除那個時間，會進行線上授課。」

慈濟大學職員說：「我現在就是在檢查電腦壞掉幾台。」同樣在花蓮的慈濟大學一樣災情嚴重，位在12樓的傳播系電腦教室，地板全擠在一起電腦以及器材設備因為地震搖晃毀損，損失慘重，整理天花版，一樓的圖書館還有多處漏水以及天花版破損，今(8)日停課不停班，一早教職員通通總動員進到校內進行復原。

慈濟大學學生說：「教室裡面大致上都是完整的，所以我覺得應該可能明天，學校就會宣布我們回去上課。」慈濟大學主任秘書何昆益說：「大學目前，我們外牆跟這個，有部分磁磚有脫落，那主結構是沒有問題的。」花蓮女中今(8)日仍然正常上課，預計1週後跑完流程開始校內危樓拆除作業，拆除作業開始讓全校師生線上上課，慈濟大學在今(8)日停課不停班，校內職員全方面檢查校園安全，9日讓學生自行選擇線上或正常上課，在10日之後正常上班上課。

而東華大學也因為多處建築毀損嚴重，需要進行復原以保障學生安全，東華大學火燒，東華大學理工學院，更因為地震引起火災燒毀，結構受損嚴重也被貼上紅單，校方已經決定異地重建，花蓮大地震災後重建期，校方要盡速將校園復原，不讓學生受教權受到影響。