選完了院長，但爭議卻沒隨著韓國瑜當選而平息；有媒體人爆料，綠營開價八位數要拉藍營跑票，就是為了保住立院院長的位置，對此民進黨發言人吳崢喊要告，民眾黨立院黨團總召黃國昌更是直說，立法院長選舉扯出金錢交易很嚴重，當事政黨應該說清楚；另一邊，新科院長韓國瑜當選第一天神隱，傳出他是為了延攬人才，立法院秘書長確定由公務員出身的前考試委員周萬來出任。

選立院院長當天，國民黨盯票盯很緊，一度傳出有四個立委有可能跑票，甚至還有名嘴爆料，綠營為了搶院長開出八位數天價，要拉票。民眾黨立院黨團總召黃國昌說：「(媒體人爆)開出了八位數想要來斡旋...，真的假的，層次low到像地方議會正副議長，竟然傳出有所謂的金錢交易，我想相關當事人和政黨，必須要說清楚講明白，這絕對不是一個可以輕輕帶過的事情。」

民進黨發言人吳崢說：「在沒有證據就含沙射影，傷害民進黨名譽的狀況之下，民進黨將會提起反擊，也必要時將會採取法律行動，以正視聽。」立法院龍頭動輒得咎，到底有沒有開價，綠營跟民眾黨反應很大，反倒是國民黨籍新科立法院長韓國瑜，當選第一天沒來上班，據傳他是去找人才了。

韓國瑜在臉書上發文，表示國會新氣象，從化解朝野不必要的惡意開始；立法院秘書長人選，也已經確定由前考試委員周萬來，出任。現年72歲，公職生涯大多在立法院任職，嫻熟議事運作和相關法規，更傳出周萬來是由王金平引薦，沒有政黨色彩，由公務員出身。選完了院長，未來三黨不過半的國會，政治角力已經拉開序幕。