基隆一名2歲男童確診，抽搐高燒到42.2度，13日送到部立基隆醫院後，再轉院到台北榮總，還是宣告不治。對此，衛福部政務次長薛瑞元認為，基隆市衛生局沒有善用緊急醫療應變中心，也就是EOC系統，才會延誤轉院，基隆市衛生局對此嚴正駁斥，強調EOC系統每小時才更新一次床位，實際操作用EOC系統比一間間打電話還要慢。指揮官陳時中則表示，雖然沒有透過EOC系統，但基隆市衛生局當時只有處理一個病患，所以沒有延誤轉院的問題。

救護車駛進醫院，努力搶救每一個生命，但基隆一名2歲男童確診，高燒抽搐研判是病毒性腦炎，經過轉院還是宣告不治，衛福部次長薛瑞元說：「地方的衛生局沒有善用我們的EOC，那如果經由那邊的話，那EOC的人員就可以看這個病房的情形，然後直接就指引他們到轉送的醫院。」

基隆市衛生局長吳澤誠VS.記者說：「一通電話有沒有(病床)，有時候一分鐘兩分鐘三分鐘就可以解決，(所以你覺得用這個電話反而比那套系統來得更快)，我不敢這樣講，但是就昨天的經驗並沒有更慢。」兩邊各持己見，依時間線來看，這名2歲林姓男童，13日抽搐高燒42.2度，晚上7:43到部立基隆醫院檢傷，將近3個小時後醫院才向基隆市衛生局提出轉院，但為什麼花了3小時醫院沒有回應。

衛生局一間間撥打醫院電話，在晚上11:26和台北榮總連繫上，11:56才安排救護車和護理師到北榮，從進院到轉院將近4小時，而薛瑞元所提的EOC系統，全名是緊急醫療應變中心，需要跨縣市轉院時可以請他們協助交接，但基隆市衛生局主張，EOC系統每小時才更新一次床位，至少要花費將近2個小時，一家家詢問反而只花一個小時，中央和地方戰火一觸及發，指揮官陳時中趕緊出來緩頰。

中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中說：「次長並沒有要指責任何人的意思，在流程的銜接上或許有一些不順暢，但是在執行這個業務的當事人並沒有延誤的情形。」試著把REOC開放給傳染病來做，第一系統公文剛發下去有些沒有到，第二個那天情況只有一個病人沒問題，執行業務當事人沒有延誤情形，兒童染疫病程快速，改善送醫轉院的SOP，需要趕快到位，才能避免下一個憾事發生。

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