這次公投結果，四項議題都沒有通過，其中在第18案，反萊豬進口的項目中，竟然連全台養豬頭數最多的雲林縣，也是不同意大於同意，縣長張麗善說，雖然雲林投票率只有三成，結果不能代表全體縣民，但還是會尊重，也強調，未來會嚴格確保雲林的豬肉品質，另外全台第三大養豬戶的彰化，投票結果也是支持萊豬進口，縣長王惠美說，既然大家同意萊豬進口，也只能繼續把關食安。

公投大選結束，四項議題都沒有通過，而在第18案反來豬進口項目中，連全台養豬頭數最多的，雲林縣不同意票竟然比同意票多了2萬多票，雲林縣長張麗善說：「我們覺得非常的遺憾，因為我們還是要堅守食品安全，尤其是養豬大縣，雲林縣的豬隻跟雲林縣的肉品。」縣長張麗善說，這次雲林投票率只有3成多，認為結果不能代表全體縣民的民意，但還是接受結果，未來會嚴格確保雲林的豬肉品質。

另外，也是全台第三大養豬戶的彰化，在反萊豬進口的議題上，結果也是支持萊豬進口，彰化縣長王惠美說：「絕對尊重那對於這個民眾的食安，我們會繼續嚴格把關。」王惠美強調會尊重公投結果，但彰化當地農會理事長也說，既然投票結果，是贊成萊豬進口，就希望農委會要提出具體的辦法，保護國產豬肉和養豬戶。