國產高端疫苗通過食藥署的緊急授權EUA，可以進入專案製造階段，不過卻有國內專家不贊同這項決議，認為高端疫苗無法提出對變種病毒株的防護力數據，而食藥署提出高端的中和抗體效價，比AZ高出3.4倍，並不等於對人體有足夠的保護力，指揮中心回應，不管疫苗對變種病毒有沒有防護力，至少絕對能降低染疫後的重症率，至於審查過程為何不公開，陳時中說與會專家都怕被獵巫，也擔心無法充分討論。

高端疫苗19日通過緊急授權，終於有機會讓20歲國人打到國產疫苗，食藥署公布審查通過的主因，指出高端疫苗對抗病毒的中和抗體效價平均數，是AZ疫苗的3.4倍，不過這一項優勢，卻被專家提出質疑，前台大醫院感染科醫師林氏璧說：「中和抗體這個指標，到底可不可以直接就對應到，做臨床試驗或是在真實世界的保護力，這點是有爭議的，假如它真的那麼簡單的話，國際早就訂出標準了。」

台大醫院兒童醫院院長黃立民說：「到底什麼樣的抗體叫做有保護力，大家得到一個一致的見解，這個時候它就可以由它的抗體的量，來知道它大概保護力是多少。」中華民國防疫學會理事長王任賢說：「如果對一個一成不變的病毒，(中和抗體)確實能夠代表保護力，但是對一個像新冠這樣變化多端的病毒，它就完全不能代表保護力，這個是一個天大的錯誤。

到底高端疫苗對變種病毒有沒有效，中和抗體效價能不能當作指標，指揮中心認為疫情當前，不需要用太過嚴苛的標準，來審查申請緊急授權的疫苗，中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中說：「病毒株也都是一直在變，很難去證明說它的確效，對於重症的防護力，相對是比沒有打疫苗絕對是來得比較好。」

對於外界的質疑，高端還沒有通過第三期臨床試驗，高端也發出聲明表示，已經在巴拉圭取得三期試驗核准，將開始收案1000人進行試驗，希望完成更安全的人體監測，而緊急授權的審查過程，指揮中心依舊定調不會公開，就怕與會的專家學者成為外界獵巫的對象。