北農群聚染疫引發全台關注，中央祭出明(24)日開始，進出雙北市批發市場，必須持有篩檢陰性證明。不過，台北市所謂的篩檢，指的是快篩；但是中央卻建議直接進行PCR採檢，指揮官陳時中認為，台北市採用快篩跟PCR同時做，等候結果的時間就會擠壓到每個人檢驗的時間。

而且快篩會有偽陰性的問題，恐怕會有防疫漏洞，陳時中表示台北市的篩檢量能如果不足，可以要求中央支援，不過柯文哲回應，快篩成本只要不到兩百元，PCR至少要四千五，因此採取先快篩的做法。中央跟地方篩檢政策不但不同調。

今(23日)一早陳時中和柯文哲兩人更是一前一後視察北農，引發彼此較勁的聯想，至於新北市，雖然對於果菜市場也是採取快篩的作法，但是卻不加入中央跟北市的論戰，只強調，新北市的篩檢量能足夠，歡迎北農或環南市場相關人員到新北市快篩。

衛福部長陳時中清晨突擊三個果菜市場，其中一站北農第一果菜市場，市場人聲鼎沸，有業者拍手後向陳時中吐苦水，而現場陪同的除了有農委會主委陳吉仲，還有「兩度扛起前進指揮所」控制疫情重任的王必勝，不免被人質疑，是否又要派王必勝出場。

而陳時中前腳剛離開北農，台北市長柯文哲也到了，兩人一前一後難道在較勁嗎，柯文哲表示早就排好了六點半到北農，後來聽到陳時中四點要來，也只能表示歡迎，北農21-23日，篩檢了3200人，快篩陽性11人，只有0.34%，比整個北市還要低，PCR陽性則是4人，中央要求6月24日開始，進出雙北市批發市場，必須持快篩陰性證明，為了讓業者能夠進出，北市原本都是PCR和快篩同時進行，但速度較慢，針對北農採取陽性就測PCR，陰性就給證明，之後安排打疫苗兩週內完成PCR篩檢。

但是陳吉仲在臉書PO文，表示為了加速篩檢效率，建議直接進行PCR採檢，難道中央跟地方又是不同調？柯文哲說北農和苗栗不同，苗栗移工住宿舍，北農人流全台都有，跨縣市疫調需要中央整合，週三晚間中央地方開會討論。