為了減輕前線急診檢疫人員負擔，台南市衛生局特別製作貨櫃採檢屋，首站設立於衛生福利部台南醫院，減少醫護人員執行相關處置時與病人接觸，也因為貨櫃的移動方便特性，哪裡需要進行大量檢測，就往哪裡去，避免疑似症狀個案四處移動，造成更大的感染風險。 採檢人員全副武裝，隔著玻璃門，藉由作業手套，進行採檢，台南市長黃偉哲特地前來了解，因為這套設備相當特別，轉往外頭看，竟然是利用貨櫃屋打造，長方體貨櫃一分為三，加裝門片及隔間，就成了三間獨立的採檢區，密封式隔離，阻隔病毒穿透。 衛福部台南醫院感染科主任洪元斌說：「貨櫃屋他本身就會有負壓的功能，使得我們人員在採檢過程中，比較不會有受到感染的疑慮。」貨櫃採檢站最厲害的，就是可以隨時移動，哪邊有社區感染，就移到那裡去，避免龐大就醫人潮，群聚醫療院所，增加感染風險。 台南市長黃偉哲說：「既然名為移動式，就表示它可以到任何地方，不管是在空曠的地方還是在醫院前面，它都不需要進去醫院內部。」衛福部台南醫院感染科主任洪元斌說：「那如果今天我們，有一些社區需要採檢的狀況，本身又有負壓的功能，對我們的幫忙非常的大。」醫護人員省去穿脫裝備時間，隔著透明窗不跟採檢者直接接觸，不僅對病患或醫護人員來說，都能節省時間，安全性也大幅提升。