海軍敦睦艦隊24人染疫，參謀總長黃曙光曾在15日艦隊靠岸時親自主持結訓典禮，接觸到艦上官兵。而總統府今(20)日也證實，黃曙光在16日曾進入總統官邸參加例行會議，並與總統會面，不過，黃曙光全程戴口罩，而且與總統相隔5公尺距離。對於總統健康的部分，有專業醫療團隊加強關注，會以最嚴格標準檢視。然而，針對國軍這次防疫的嚴重疏失，蔡總統有三點重要指示，要求務必徹底檢討、坦誠以對。來聽總統府的最新說明。 而這次事件攸關國內疫情管控，以及社會對國軍的信任，蔡總統強調這絲毫沒有鬆懈的空間，特別要求國軍嚴格遵守中央疫情指揮中心的指引與規定，同時，要求醫療體系也要妥善照顧染疫的官兵。 總統府發言人丁允恭：「總統表示防疫視同作戰，國軍的責任是保護國家跟國人，更應該去保持最高度的警覺，這一次敦睦艦隊集體染疫，造成了社會大眾的疑慮，總統表示遺憾，國軍除了表達向社會致歉，承擔應有的責任以外，更應該以此為鑑，徹底來檢討防疫管理的作為，第二點國軍除了全力配合，指揮中心的疫調之外，國防部的調查小組，也應該要詳細地釐清過程，既然已經造成了防疫的缺口，就應該要坦誠以對，絕對不能夠再有任何的疏漏。」