武漢肺炎疫情擴大，疾管署日前宣布對中國旅客來台採取限制，交通部今(30)日表示，應金門小三通航線營運所需，自2月1日起調整航班數量及時刻表，後續將視航線營運狀況適時調整因應。 武漢肺炎疫情持續蔓延，截至下午6點，台灣已出現9例確診案例。為了防範由新型冠狀病毒引起之「嚴重特殊傳染性肺炎」擴散至台灣，中央流行疫情指揮中心於26日對中國籍人士來台採取限制措施，全面暫緩中國旅客以小三通到金門、馬祖、澎湖等離島地區。交通部航港局今日表示，金門小三通的金廈航線及金泉航線旅客量，自管制措施實施以來均已下降。交通部與金門縣政府、航商及大陸廈門水運管理部門協商，已獲得共識。

航班數量及時刻表異動如下:

「金門-廈門」航線調整為每日8班，上午10時30分、12時、下午1時30分及3時由金門及廈門雙方碼頭發航對開 「金門-泉州」航線調整為每日2班，上午11時10分由泉州開往金門、下午1點40分由金門開往泉州。 若仍有大量旅客無法順利搭船時，則啟動臨時性加班船機制因應。 航港局表示，已請兩岸航商於營業場所、售票處公告周知，並務必通知到每位已訂位之旅客，且退票不得收取手續費，妥善處理運務，航港局呼籲各位旅客於出發前密切注意航班異動訊息，或可至交通部航港局官網查詢。