中共對台的滲透和情報蒐集工作，其實除了中國國台辦還有情報單位。國台辦負責兩岸事務交流與表態，但學者指出，國台辦還是有情報蒐集功能，會將得到的情報橫向給統戰部門。學者說明，中共的情報系統分為「軟系統」，軟系統包括統戰部「中宣布」，負責對外滲透，而硬系統，有國安部、公安部以及「軍委聯合參謀部情報局」。中國國台辦則是輔助情報系統。

大至台灣和美國的軍購案，或是消防署長蕭煥章在台灣宮廟的全民安全指引宣講會上說中國是壞鄰居，中共中央台灣辦公室簡稱「國台辦」，對台灣的任何動態都牢牢地掌握，中國國台辦發言人陳斌華說：「我們堅決反對美國，與中國台灣地區，開展任何形式的軍事聯繫。」

中國官方規定寫，國台辦職能及編制，包括研究擬定對台工作方針組織中國各地對台工作等以及「完成黨中央、國務院交辦的其他任務」，國台辦和中國情治單位，例如中國國家安全部公安部和中共中央委員會統一戰線工作部等部門都隸屬於中國國務院，中共中央統戰部的職責之一就包括展開對台統戰工作。

中華亞太菁英交流協會祕書長王智盛說：「當然你必須承認說，國台辦它還是有這個情報蒐集，或者是統戰滲透的，這樣子的一個職能。不管是國台辦也好或者是相關統部門也好，它其實都服務於有一個叫做中共中央對台小組，我相信國台辦它也會把它在兩岸事務中，所蒐集到的或者是綜整的資訊，透過這樣子橫向給相關的統戰部門或者是國安部門。」

而中共的情報系統，有其他學者形容就像八爪章魚局部分工也會橫向聯繫，國防院戰略及資源所長蘇紫雲說：「多個系統又可以分為，軟系統跟硬系統兩個區塊，軟系統指的就是統戰部中宣布，它是負責所謂的對外滲透，硬的部分就包括國安部公安部以及解放軍的聯合情報部的情報局，就是正規的情報系統。」

其中在「軟系統」部分包含統戰部和中宣布，主責認知作戰以及對目標的各種團體人脈滲透，另外「硬系統」包括中國國安部，負責中國內外部情報以及公安部負責中國內部反情報工作，還有軍委聯合參謀部情報局主責各戰區政戰單位。

而另外也有研究指出，中共在2018年底的「省級機構改革方案」把各省級政府原設本設有的「國家安全廳」以各省委辦公廳「國家安全委員會」取代，由中共中央國家安全委員會直接領導，而中共國家安全委員會的主席就是習近平，國防院戰略及資源所長蘇紫雲說：「至於國台辦，它是屬於公開政情的蒐集，就變成輔助正規情報作業的一環了。」

而在中共的對外情蒐工作，由和中共官方關係密切的智庫大學公司人員等，透過一些商務社交網站，以邀訪演講提供工作機會等接觸潛在對象，邀請對方前往中國參加會議或洽談合作，接著交互利用四大手段，包括金錢、意識形態、威脅恐嚇、自我實現，吸收目標。中國情報系統綿密對台滲透與情報蒐集多管齊下。