在0403強震後，全台餘震不斷，在今(25)日凌晨2點11分，還發生一起芮氏規模5.6的地震，幾乎全台有感，但地震震度不大，花蓮3級、宜蘭則有2級，不過地震中心卻表示，這起地震不是0403強震的餘震，而是獨立事件，發生位置在南澳海盆，除了這起最有感的地震，同樣的震央位置總共震了4次，有專家推估，獨立地震的發生，可能稍微減少0403餘震的次數。

受到地震影響，吊燈輕微搖晃，在0403強震後，每天幾乎都會出現，這樣的景象，今(25)日凌晨，一連發生的四起地震，芮氏規模在3.9到5.6之間，又以凌晨2點11分、12分，連續兩起規模5.6、5.5的地震，全台有感，最大震度在花蓮3級宜蘭2級，不過地震中心卻表示，這四起地震和0403強震無關，是獨立震源。

台大地質科學系特聘教授吳逸民說：「(震央)距離比較遠的時候，這個P波S波拉開的時間就會變長，所以你會覺得搖晃的時間可能長一點點。」專家指出台北因為盆地地形，容易受到場址效應，感覺到的震度就會比較大，而因為南澳海盆距離台灣較遠，誤差較大，所以宜蘭一度收到國家級警報，不過看看地質剖面圖，今(25)日這四起地震，震源在海上，離台灣比較遠，震央在南澳海盆。

而0403強震，主要發生的地方都在嶺頂斷層破碎帶，震央位置和成因皆有不同，中央大學地質研究所教授李錫堤說：「0403地震之後呢，全台灣的餘震都集中在整個斷層附近的餘震帶裡面，別的地方地震反而變少了，南澳海盆發生之後，我們的(403強震)餘震應該會變少，應該會明顯變少。」

0403強震後，餘震一再發生，截至今(25)日早上十點，已經累積1200起地震，在半年到一年內，還是可能會有餘震發生，提醒民眾得做好防震準備。