邱鎮軍被指控經營電子遊藝場的這棟大樓，頂樓還有加蓋鐵皮違建，雖然邱鎮軍強調，之前有經營電玩機台公司，2018年當選苗栗市長後，就把公司轉給其他朋友，並非如媒體報導的電子遊藝場鄭姓男子，但經濟部工商登記資料顯示，公司和電子遊藝場，登記是同一個地址，2019年起，公司負責人也更改為遊藝場業者鄭姓男子，而邱鎮軍也多次出現在遊藝場的烤肉場合，至於違建部分是否要立即拆除？縣府強調還要實際勘查違建面積，如果違反建築法，就依規定辦理。

位在苗栗市北安路上這家遊藝場，住商大樓4層樓建築，邱鎮軍就住在4樓，但頂樓還有鐵皮加蓋，還標明私人住宅，這個違建是什麼時候出現的？邱鎮軍強調，這棟建築是97年建造，他在101年購買時，加蓋部分就已經存在，屬於縣府列管的既存違建，苗栗縣工商發展處使用管理科長范宸寧說：「我們初步判斷，它應該是有五樓頂樓加蓋的違建，實際的違建面積我們還要調閱相關資料，如果涉及違反建築法部分，我們後續將依建築法規定辦理。」

邱鎮軍還被綠營指控，101年擔任進口電玩機台公司負責人，後來還疑似把負責人改為遊藝場業者鄭姓男子，苗栗縣工商發展處工商科長詹智為說：「地上1樓2樓地下1樓，是屬於合法登記有案的電子遊藝場。」邱鎮軍強調，自己2018年當選市長後，因為公務繁忙，就把公司轉讓朋友，並非綠營所指的鄭姓男子，但經濟部工商登記資料顯示，2019年起，公司負責人就是鄭姓男子。

邱鎮軍還多次出現在遊藝場的烤肉場合，名嘴李正皓還質疑，遊藝場內部和周邊所發生的毒品交易，被法院判決在案就有46次，遊藝場和電玩機台公司登記，又是同一個地址，公司內的分機電話，還能直接遙控遊藝場，邱鎮軍很難撇清關係。

苗栗立委參選人(無)曾玟學說：「邱鎮軍市長竟然是苗栗市的電子遊藝場，的幕後老闆，警方從2012年到2018年，查獲了超過30起毒品交易案，同時他的五樓更是違建，而這個樣子的傳聞，其實在地方不是沒有聽聞過。」邱鎮軍透過書面聲明，認為一切是綠營選舉抹黑操作，但眼前攤開的事實，可能還需要當事人，出面解釋清楚。