台北市市場感染連環爆，台北市被質疑沒做疫調，市府立刻打臉說有做，做得還是精準疫調，台北市長柯文哲直接反問，不做疫調的話，那我們關在防疫旅館的人怎麼來的？中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中，被問到這個問題，說北市資料有上傳法傳系統，但確實資料不多，被台北市府發言人陳智菡怒嗆，內行人不要說外行話。

台北市長柯文哲說：「如果不做疫調的話，不匡列、不隔離，那我們現在關在防疫旅館裡面那些人是怎麼來的。」市場感染連環爆，北市一度被批評沒做疫調，會讓大家誤會的，恐怕就是柯文哲5/16說的這段話。

台北市長柯文哲(2021.05.16)說：「現在已經到幾百人了，已經沒有辦法做有效的疫調，以前的那種零確診時代的疫調，那很精確的然後公布足跡，現在已經不切實際了。」

不過到了6/5，市府提出了精準疫調，柯文哲解釋，隨著疫情變化戰術也會不同，也批評名嘴造謠眾口鑠金。台北市長柯文哲說：「台灣社會是政媒合一，讓我們開了眼界你知道，每天這樣這樣做假新聞，講到最後連知識分子都會相信，這就是可怕。」

發言人陳智菡更秀出疫調單，強調針對每個個案天天都在做，更回嗆下午陳時中的這段話。中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中說：「法傳的資料有上傳，那疫調大家可以上網去看，那確實資料是不多，那不過現在一切都要回復到，我們精準疫調的這樣的一個方式來做。」

台北市政府發言人陳智菡說：「內行人不要說外行的話，我們來看一下剛剛陳指揮官，他所說的應該就是在指這個網頁，這個網頁上頭是公開的資訊，跟法傳系統完全是不一樣的東西，那麼為什麼會上面的資訊會比較少呢，因為法傳系統是有權限的，我剛剛給大家看到的這個疫調資料，是有權限的人才可以上去看，是防疫相關的一個人員才能看的。」

北市強調，資料都有上傳法傳系統，也解釋在民眾看得到的一般網頁，沒有公布所有疫調足跡資料，是因為中央授權地方公布時，北市個案已經太多，避免營造假象的安全感，所以沒有公布，但跟沒做疫調，可是兩回事。